Personalized neoantigen-based cancer immunotherapy. A literature review / Inmunoterapia personalizada contra el cáncer basada en neoantígenos. Revisión de la literatura

Abstract Introduction: The progress made in cancer immunotherapy and the clinical response of patients who have undergone this type of therapy have made it the fourth pillar of cancer treatment. Objective: To briefly describe the biological rationale of personalized neoantigen-based cancer immunotherapy, the current perspectives regarding its development, and some of the clinical outcomes achieved with this therapy. Materials and methods: A literature search was performed in PubMed, Scopus and EBSCO using the following search strategy: type of articles: original experimental studies, clinical trials, and narrative and systematic reviews addressing methods to identify mutations found in tumors and cancer immunotherapy strategies based on neoantigen-based vaccines; study population: humans and animal models; publication period: January 1989 - December 2019; language: English and Spanish; search terms: "Immunotherapy", "Neoplasms", "Mutation" and "Cancer Vaccines". Results: The initial search started with 1 344 records. Once duplicates were removed (n=176), 780 studies were excluded after reading their abstract and title. The full text of 338 articles was read to confirm which met the inclusion criteria, finally including 73 studies for full analysis. All articles retrieved were published in English and were mainly conducted in the USA (43.83%) and Germany (23.65%). In the case of original studies (n=43), 20 were performed in humans only, 9 in animals only, 2 in both models, and 12 used in silico methodology. Conclusion: Personalized cancer immunotherapy with tumor neoantigen-based vaccines is strongly emerging as a new alternative to treat cancer. However, to achieve its appropriate implementation, it is necessary to use it in combination with conventional treatments, produce more knowledge that helps clarify cancer immunobiology, and reduce the costs associated with its production.

Resumen Introducción. Los avances que se han hecho en inmunoterapia contra el cáncer y la respuesta clínica de los pacientes que han recibido este tipo de terapia la han convertido en el cuarto pilar para el tratamiento del cáncer. Objetivo. Describir brevemente el fundamento biológico de la inmunoterapia personalizada contra el cáncer basada en neoantígenos, las perspectivas actuales de su desarrollo y algunos resultados clínicos de esta terapia. Materiales y métodos. Se realizó una búsqueda de la literatura en PubMed, Scopus y EBSCO utilizando la siguiente estrategia de búsqueda: tipo de artículos: estudios experimentales originales, ensayos clínicos y revisiones narrativas y sistemáticas sobre métodos de identificación de mutaciones generadas en los tumores y estrategias de inmunoterapia del cáncer con vacunas basadas en neoantígenos; población de estudio: humanos y modelos animales; periodo de publicación: enero de 1989 a julio de 2019; idioma: inglés y español; términos de búsqueda: "Immunotherapy", "Neoplasms", "Mutation" y "Cancer Vaccines". Resultados. La búsqueda inicial arrojó 1 344 registros; luego de remover duplicados (n = 176), 780 fueron excluidos después de leer su resumen y título, y se evaluó el texto completo de 338 para verificar cuáles cumplían con los criterios de inclusión, seleccionándose finalmente 73 estudios para análisis completo. Todos los artículos recuperados se publicaron en inglés, y fueron realizados principalmente en EE. A (43.83%) y Alemania (23.65%). En el caso de los estudios originales (n=43), 20 se realizaron únicamente en humanos, 9 solo en animales, 2 en ambos modelos, y 12 usaron metodología in silico. Conclusión. La inmunoterapia personalizada contra el cáncer con vacunas basadas en neoantígenos tumorales se está convirtiendo de forma contundente en una nueva alternativa para tratar el cáncer. Sin embargo, para lograr su implementación adecuada, es necesario usarla en combinación con tratamientos convencionales, generar más conocimiento que contribuya a aclarar la inmunobiología del cáncer y reducir los costos asociados con su producción.

Human immune response to SARS-CoV-2: What is known? A scoping review / Respuesta inmune humana al SARS-CoV-2: ¿Qué se conoce? Una scoping review

Monitoring literature on the broad spectrum of the human immune response to SARS-CoV-2 is important to understand the mechanisms and progression of COVID-19. The present study undertakes a scoping review of the literature on human immune response to SARS-CoV-2 to determine the characteristics of innate and adaptive responses, as well as biomarkers and cells that play a role in the development of the infection. We searched papers in MEDLINE/PUBMED and EMBASE databases published since December 1st 2019 to to April 9th 2020 from which we selected 56 for this study. We found that the immune response is characterized by high levels of acute phase reactants, neutrophilia, low levels of NKs and eosinophils, lymphopenia, cytokine storm syndrome, exhausted T cells, impaired cytotoxic response, inadequate helper response and production of specific antibodies; concluding that immune dysregulation correlates with disease severity and high mortality.

El seguimiento de la literatura sobre la respuesta inmune humana al SARS-CoV-2 es importante para comprender los mecanismos y la progresión de COVID-19. En el presente estudio se realizó un Scoping Review de la literatura sobre la respuesta inmune humana al SARS-CoV-2 para determinar las características de la respuesta inmune innata y adaptativa, así como biomarcadores y células que juegan un papel en el desarrollo de la infección. Buscamos artículos en las bases de datos MEDLINE / PUBMED y EMBASE publicados desde el 1 de diciembre de 2019 hasta el 9 de abril de 2020, de los cuales seleccionamos 56 publicaciones para este estudio. Encontramos que la respuesta inmune se caracteriza por altos niveles de reactantes de fase aguda, neutrofilia, bajos niveles de NKs y eosinófilos, linfopenia, síndrome de tormenta de citoquinas, linfocitos T agotados, respuesta citotóxica alterada, respuesta T helper inadecuada y producción de anticuerpos específicos. En conclusión, el desequilibrio inmune se correlaciona con la severidad y la mortalidad de la enfermedad.

Prevalencia y factores asociados a la tuberculosis y las micobacteriosis en pacientes positivos para HIV en Bogotá / Prevalence and risk factors associated to tuberculosis and non-tuberculous mycobacterial infections in HIV-positive patients in Bogotá

Resumen Introducción. La tuberculosis es una de las enfermedades infecciosas de más amplia distribución en el mundo y constituye una de las primeras causas de muerte en pacientes con sida. En Colombia, en el 2015, se notificaron 12.918 casos de tuberculosis y 926 muertes. Objetivo. Determinar la prevalencia y los factores asociados a infecciones micobacterianas en pacientes infectados con el virus de inmunodeficiencia humana (HIV) en dos hospitales públicos de Bogotá. Materiales y métodos. Se hizo un estudio descriptivo de corte transversal con búsqueda activa de casos de tuberculosis y micobacteriosis en pacientes positivos para HIV. Se estudiaron variables demográficas, sociales, clínicas y de hábitos personales. Los análisis estadísticos se hicieron con el programa Stata 13TM. Resultados. Se incluyeron en el estudio 356 pacientes: 81,2 % hombres y 18,8 %, mujeres, con una media de edad de 36,5 años. La frecuencia de la tuberculosis fue de 19,9 % (IC95% 15,9-24,5 %) y la de infecciones por micobacterias no tuberculosas, de 3,9 % (IC95% 2,16-6,5 %). El análisis bivariado evidenció una asociación estadísticamente significativa entre la tuberculosis y el conteo de linfocitos TCD4+ (p=0,003), la carga viral (p=0,0008), el tratamiento antirretroviral (p=0,017) y un índice de masa corporal (IMC) menor de 18 kg/m2 (p=0,000). En las micobacteriosis solamente se presentó asociación estadísticamente significativa con el IMC (p=0,017) y con el conteo de linfocitos TCD4+ (p=0,045). Conclusión. Los factores asociados al deterioro del sistema inmunitario causados por el HIV, así como el no administrar el tratamiento antirretroviral de gran actividad y el IMC, constituyeron factores de riesgo para desarrollar la tuberculosis.

Abstract Introduction. Tuberculosis is one of the most widely distributed infectious diseases worldwide. It is the most common cause of mortality among AIDS patients. In Colombia, 12,918 tuberculosis cases were notified, and 926 deaths were reported in 2015. Objective. To determine the prevalence and risk factors associated to mycobacterial infections in HIV-positive patients in two public hospitals from Bogotá. Materials and methods. A prospective and descriptive study was carried out by an active search for tuberculosis cases and non-tuberculous mycobacterial infections in HIV-positive patients. We considered demographic, social, clinical, and personal habits as variables. Statistical analyses were done using Stata 13TM software. Results. Three hundred and fifty six patients were included, 81.2% were men and 18.8% were women; the mean age was 36.5 years. Tuberculosis infection had a frequency of 19.9% (95% CI: 15.9-24.5%) and non-tuberculous mycobacterial infection had a 3.9% frequency (95% CI: 2.16-6.5%). Bivariate analysis showed a statistically significant association between tuberculosis infection and CD4+ T cell counts (p=0.003), viral load (p=0.008), antiretroviral therapy (p=0.014), and body mass index (BMI) <18 kg/m2 (p=0.000). In non-tuberculous mycobacterial infections there was a statistically significant association with BMI (p=0.027) and CD4+ T cell counts (p=0.045). Conclusion. Factors associated with an impaired immune system caused by HIV infection are an important risk factor for developing tuberculosis. The lack of antiretroviral therapy and the BMI were also important risk factors for tuberculosis.

Mycobacterium tuberculosis ESAT-6 antigen immunogenicity in Owl Monkeys

La única vacuna disponible contra la tuberculosis es la cepa Mycobacterium bovis BCG, que ofrece una eficacia protectiva variable (0/100-80/100), siendo urgente un nuevo agente profiláctico. Se han evaluado diversos candidatos a vacuna contra este patógeno, en los modelos animales de experimentación convencionales (murino, cobayo, conejo), obteniéndose información básica sobre el efecto de la vacuna en la carga bacterial frente a un reto infeccioso, así como también la reducción o prevención de la patología en los pulmones u otros órganos blanco; además de los aspectos relacionados con la respuesta inmune hacia el Mycobacterium tuberculosis. Los primates no humanos tienen ventajas sobre los modelos convencionales en la evaluación de vacunas, de hecho se ha verificado el comportamiento de agentes terapéuticos en humanos después de haber sido medida la capacidad protectiva de éstos en monos con tuberculosis inducida. Los primates mas estudiados en la infección por micobacterias son el cynomulgus, y el rhesus, observándose que estos animales mantienen la infección en un estado subclínico, muy similar a la tuberculosis humana donde el 90/100 de la población infectada mantiene la infección en un estado latente. Dado que el modelo animal debe semejar el comportamiento de las proteínas estudiadas en el ser humano, el mono Aotus puede representar ventajas en la investigación de tuberculosis por ser un primate con aproximadamente un 90/100 de similitud al humano en cuanto a las moléculas del sistema inmune estudiadas hasta hoy. La proteína ESAT-6 de (early secretory antigenic target 6 kD) de Mycobacterium tuberculosis es un componente minoritario del filtrado de cultivo de corto tiempo (CFP), ha sido genética y químicamente caracterizada e induce una potente respuestainmunogénica del tipo TH1. Este antígeno es secretado durante la fase inicial de crecimiento siendo fuertementereconocido por animales y humanos infectados por Mycobacterium tuberculosis...